База данных генома человека GDB - GDB Human Genome Database

База данных генома человека GDB
Содержание
Типы данных
захвачен		Данные генетического картирования
ОрганизмыHomo sapiens
Контакт
Исследовательский центр
Основное цитированиеPMID  2041809
Дата выхода1989

В База данных генома человека GDB была собрана коллекцию человеческих геномный данные. Это была ключевая база данных в Проект "Геном человека"[1][2] Находился на вооружении с 1989 по 2008 год.

История

В 1989 г. Медицинский институт Говарда Хьюза предоставили финансирование для создания центрального хранилища человеческих генетическое картирование данные. В конечном итоге этот проект привел к созданию GDB базы данных генома человека в сентябре 1990 года.[3][4] Для обеспечения высокого уровня качества записи в GDB подвергались процессу курирования специалистами по генетике человека, включая Комитет по номенклатуре генов HUGO.[5]

Основанная под руководством Питера Пирсона и Дика Люсьера,[6] GDB получил финансовую поддержку от Министерство энергетики США и Национальные институты здоровья.[3] Расположен в Школа медицины Университета Джона Хопкинса, GDB стал источником высококачественных картографических данных, которые были доступны как в Интернете, так и в многочисленных печатных публикациях.[нужна цитата ] Проект получил международную поддержку со стороны ЕС, Японии и других стран.

В свое время у GDB было несколько директоров. Питер Пирсон, Дэвид Т. Кингсбери, Стэнтли Летовски, Питер Ли и А. Джейми Кутиккья.[нужна цитата ]

В 1998 году смена фокуса в проекте генома человека перенаправила средства Министерства энергетики США, которые ранее были доступны для GDB.[7] Однако в том же году А. Джейми Кутиккья получил финансирование из канадских государственных и частных источников для продолжения деятельности GDB. Хотя обработка данных продолжалась в Johns Hopkins, центральные операции GDB были перенесены в Больницу для больных детей (HSC) в Торонто, Онтарио, Канада.[8] В ноябре 2001 года HSC уволил Кутиккию из-за спора по поводу доменного имени веб-сайта GDB.[7]

В 2003 г. RTI International стал новым хостом для GDB, где он продолжал поддерживаться как общедоступный ресурс;[9] GDB был закрыт в 2008 году после того, как контроль над проектом вернулся к Джонсу Хопкинсу.[10]

Рекомендации

  1. ^ "Новости генома человека, сентябрь-декабрь 1995: 7 (3-4): 15". web.ornl.gov.
  2. ^ Guyer, M. S .; Коллинз, Ф. С. (21 ноября 1995 г.). «Как продвигается проект« Геном человека »и что мы узнали на данный момент?». Труды Национальной академии наук. 92 (24): 10841–10848. Дои:10.1073 / пнас.92.24.10841.
  3. ^ а б Кутиккья, А. Джейми; Fasman, Kenneth H .; Кингсбери, Дэвид Т .; Роббинс, Роберт Дж .; Пирсон, Питер Л. (1993). "База данных генома человека GDB TM за 1993 г.". Исследования нуклеиновых кислот. 21 (13): 3003–3006. Дои:10.1093 / nar / 21.13.3003. ЧВК  309725.
  4. ^ Кутиккья, А.Дж. (27 декабря 1999 г.). «Будущее видение базы данных генома человека GDB». Человеческая мутация. 15 (1): 62–67. Дои:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (200001) 15: 1 <62 :: AID-HUMU13> 3.0.CO; 2-R. PMID  10612824.
  5. ^ Летовский, С. (1 января 1998 г.). "GDB: База данных генома человека". Исследования нуклеиновых кислот. 26 (1): 94–99. Дои:10.1093 / nar / 26.1.94.
  6. ^ Пирсон, П. (25 апреля 1991 г.). «База данных генома (GDB) - репозиторий картирования генов человека». Исследования нуклеиновых кислот. 19 (доп.): 2237–2239. Дои:10.1093 / nar / 19.suppl.2237. ЧВК  331357.
  7. ^ а б Бонетта, Лаура (ноябрь 2001 г.). "Увольнения оставляют базу данных генов разваливающейся". Природа. 414 (6862): 384–384. Дои:10.1038/35106703.
  8. ^ "Новости генома человека, том 10, № 1-2, февраль 1999 г.". web.ornl.gov. Получено 3 сентября 2020.
  9. ^ Зеевальд, А. (2004). «Рейтинг BioMinT: исследование производительности, локальный поиск и распознавание омонимии». Материалы симпозиума по изучению знаний в области информатики наук о жизни (KELSI 2004).
  10. ^ Гальперин, М.Ю .; Кокрейн, Г. Р. (1 января 2009 г.). «Ежегодный выпуск базы данных по исследованию нуклеиновых кислот и онлайн-сборник базы данных NAR по молекулярной биологии в 2009 году». Исследования нуклеиновых кислот. 37 (База данных): D1 – D4. Дои:10.1093 / nar / gkn942.

внешняя ссылка